截至2022年底,贝瑞基因累计服务三代测序检测样本量突破10万人份、服务终端客户超过1500家,成为长读长测序临床转化的重要落地样本。从全球看,长读长测序长期由 PacBio 与 ONT 两条单分子技术路线主导,illumina、华大智造等厂商陆续布局,中国企业在测序仪研发与临床应用两端同时卡位,临床转化进度是当前格局演变中最值得关注的变量。
长读长测序的技术路线与全球玩家
三代测序即单分子测序,测序时无需 PCR 扩增,基于单分子的电信号或化学反应信号检测,实现对每一条 DNA 分子的单独测序。行业普遍共识是,单分子测序技术就是第三代测序技术。
其下有两条主要技术路线。PacBio 技术利用荧光标记不同的碱基,通过荧光信号时间的不同识别碱基序列;Nanopore 技术则通过改造蛋白通道,记录不同碱基穿过纳米孔时产生的电流变化,再用模式识别算法确定碱基序列。
相比二代测序把 DNA 扩增后切成不超过 200BP 的片段读取、再用算法还原,三代测序不用扩增、从头读到尾,因此被称为"长读长"。这使其在基因组重复序列区域具备二代测序难以替代的优势,但准确率目前仍只能做到 95% 左右。
国际竞争格局:巨头补位与新势力并起
过去十年,三代测序市占率不到 10%,应用多局限于基础科学研究。转折出现在科研端对长读长的重新定价:2022年4月,端粒到端粒联盟(T2T)利用长读长技术完成首个真正完整的人类基因组序列;2023年初,Nature Methods 将长读长测序评选为"2022年度最佳技术"。
产业端随之加速。收购 PacBio 失败后,illumina 在2022年初宣布推出长读长产品 Infinity,外界普遍猜测其将采用合成长读长测序技术这一变通方式;Element Biosciences、Ultima Genomics 也计划或已开始布局长读长领域;PacBio 于2022年10月推出公司史上最高通量的 Revio 长读长测序系统。国内方面,华大智造同样布局长读长测序,专注纳米孔长读长测序的齐碳生物在2022年完成7亿元C轮融资。
中国位置:从测序仪到临床转化的双向卡位
中国企业的位置体现在两个层面。一是上游测序仪与核心器件,华大智造、齐碳生物分别在长读长领域推进;二是临床转化与规模化服务能力,这是国产厂商更具差异化的一环。
贝瑞基因持续发力三代测序的临床应用转化,截至2022年底累计服务三代测序检测样本量突破10万人份、服务终端客户超过1500家,三代地贫的检测效能受到检验医学期刊 CLINICAL CHEMISTRY 的关注,该刊专门发表编辑部文章,认为三代测序技术为复杂单基因病的分子诊断带来了全新机遇。测序技术能否从科研走向常规临床,规模化样本与终端覆盖是重要观察指标。
常见问题
三代测序和二代测序的核心区别是什么?
二代测序是短读长,需将 DNA 扩增后切成不超过 200BP 的片段读取再用算法还原;三代测序是长读长,无需扩增、从头读到尾,对基因组重复序列的解析更有优势,但目前准确率仍只能做到 95% 左右。
长读长测序的全球竞争格局如何?
目前单分子测序主要有 PacBio 与 ONT 两条技术路线,illumina、Element Biosciences、Ultima Genomics 等厂商陆续布局长读长,国内华大智造、齐碳生物亦有推进。格局仍在演变,具体份额与性能表现需以后续第三方实测或公开数据验证。
贝瑞基因在三代测序临床转化上进展如何?
截至2022年底,贝瑞基因累计服务三代测序检测样本量突破10万人份,服务终端客户超过1500家,三代地贫检测效能获 CLINICAL CHEMISTRY 编辑部文章关注,被视为复杂单基因病分子诊断的新机遇。