三代测序（长读长测序）虽然单次测序成本高于二代测序，但其临床应用盈利的关键并非依赖单次低价，而是通过规模化样本量摊薄单位成本，并依托长读长技术在复杂单基因病诊断中的高附加值实现商业闭环。以贝瑞基因为例，其以三代地贫检测为切入点，截至2022年底累计服务三代测序检测样本量已突破10万人份，这一规模效应正是其探索盈利模式的核心路径。
成本结构：为何三代测序更贵
三代测序的成本压力主要源于技术与设备特性。与二代测序需将DNA扩增后切成不超过200BP的片段不同，三代测序无需PCR扩增，直接对单条DNA分子进行测序，读长可达2.4M。这一技术优势带来两大成本痛点：
- 设备与试剂投入高：无论是PacBio技术的荧光信号检测，还是Nanopore技术的电流信号识别，都需要专用设备和配套试剂耗材，单次运行成本显著高于二代平台。
- 准确率带来的重复成本：三代测序目前准确率约为95%，在需要高精度结果的临床场景中，可能产生重复测序或验证成本。
不过，三代测序的便携性和实时性优势明显，如MinION测序仪可在极地、海洋等复杂环境下工作，这为特定临床场景（如突发疫情响应）提供了差异化价值。
盈利模式：规模效应与高附加值双轮驱动
基因测序临床应用的盈利逻辑，不是单纯比拼单次测序价格，而是在成本可控的前提下，找到二代测序无法替代的临床场景。贝瑞基因的实践提供了可参考的路径：
第一，以样本量摊薄固定成本。 测序设备折旧与试剂开发属于固定投入，样本量越大，单位成本越低。贝瑞基因累计服务三代测序检测样本量突破10万人份、终端客户超过1500家，这一规模使其在供应链议价和实验室运营效率上具备较强竞争力。
第二，锁定高附加值诊断场景。 二代测序（短读长）在基因组重复序列区域存在天然短板，而三代测序可从头读到尾，有效解决这一问题。这一技术差异在复杂单基因病（如地中海贫血）的分子诊断中具有明确临床价值，检测定价空间也相应更高。该领域的工作获得了检验医学期刊《CLINICAL CHEMISTRY》编辑部文章的认可，认为三代测序技术为复杂单基因病的分子诊断带来全新机遇。
常见问题
三代测序会完全取代二代测序吗？
短期内不会。二代测序在成本和通量上仍有优势，目前市占率远高于三代。三代测序更适合需要长读长、复杂结构变异检测的特定场景，两者在临床应用上更多是互补关系。
三代测序准确率95%够用吗？
对部分复杂单基因病的初筛和结构变异检测而言，95%的准确率结合长读长优势已具备临床参考价值。但对需要极高精度位点确认的场景，可能仍需结合其他方法验证，具体以临床指南和医生判断为准。
除贝瑞基因外，还有哪些企业在布局三代测序？
行业头部企业均在布局。例如测序设备商PacBio推出了高吞吐量的Revio长读长测序系统，illumina也宣布推出长读长产品Infinity，国内初创公司齐碳生物在纳米孔测序领域完成了7亿元融资。整体来看，三代测序的临床应用转化正处于加速期。