DNBSEQ测序技术路线在技术迭代、专利纠纷和市场接受度三方面面临潜在风险与不确定性，但这些因素尚未从根本上动摇其技术竞争力。
技术迭代风险
长读长测序技术（如Nanopore）的突破可能对以短读长为核心的DNBSEQ技术形成挑战。DNBSEQ技术属于短读长测序，其优势在于测序准确率高（精准度约99.4%，灵敏度约98.8%）和重复序列占比低（小于3%），但长读长技术在解析复杂基因组区域时具有天然优势。若长读长技术成本快速下降并普及，可能削弱DNBSEQ在短读长应用场景中的市场地位。
专利与知识产权风险
DNBSEQ测序技术与Illumina存在全球专利诉讼，这直接影响市场准入和产品迭代。华大智造的技术源头来自收购的美国公司CG，在其基础上完成了一系列技术和专利完善。与Illumina的专利纠纷可能导致部分市场销售受限，或增加产品开发中的合规成本。不过，华大智造已建立自主可控的源头性核心技术体系，DNBSEQ测序技术、规则阵列芯片技术等均达到国际先进水准。
市场接受度风险
部分科研和临床用户对DNBSEQ平台的数据存在偏见或适应成本。由于Illumina长期占据全球测序市场龙头地位，其数据格式和分析生态已形成路径依赖，用户转向DNBSEQ需要学习成本。但研究对比显示，华大智造与Illumina平台的测序结果具有高可比性，且在性价比上更具优势，这有助于逐步消除市场疑虑。
常见问题
DNBSEQ技术是否在性能上落后于Illumina？
官方资料显示，Hak-Min Kim等人的研究对比了Illumina与华大智造平台，结论是两者结果具有高可比性，且华大智造在性价比上更具优势。具体性能差异需以第三方实测为准。
专利诉讼会否导致DNBSEQ退出部分市场？
专利纠纷确实对市场准入构成制约，但华大智造已通过专利完善形成知识产权保护。具体市场影响取决于诉讼结果和地区法律差异。
用户切换至DNBSEQ平台的成本高吗？
主要成本来自数据分析流程的调整，但DNBSEQ技术的高准确率（约99.4%）和低重复序列率（小于3%）可有效保证数据质量，减少数据浪费，长期使用可降低综合成本。