三代测序读长可达2.4M、无需碎片拼接,这一“从头读到尾”的能力正显著拓展基因测序的下游应用场景,并推动需求结构从科研主导向临床转化加速演进。与二代测序(读长通常不超过200BP,需将DNA切成小片段再算法拼接)相比,三代测序的长读长优势直接解决了重复序列难以精准测序的痛点,在复杂基因组组装、全长转录本测序、结构变异检测等领域具有不可替代的价值。例如,2022年端粒到端粒联盟(T2T)利用长读长技术完成了首个真正完整的人类基因组序列,补齐了此前二代测序无法覆盖的8%区域;2023年,长读长测序被Nature Methods评选为“2022年度最佳技术”,被业界视为未来方向。

受益应用场景:从科研突破到临床转化

三代测序的长读长(最长可达2.4M)和无需PCR扩增的特点,使其在多个场景中直接受益:

  • 复杂基因组组装:长读长可跨越重复区域,实现从端粒到端粒的无间隙组装,如T2T联盟完成人类全基因组序列的里程碑工作。
  • 全长转录本测序:可直接对RNA进行测序,避免逆转录引入的偏向性和突变,更准确识别转录本异构体。
  • 结构变异检测:长读长能覆盖大片段缺失、插入、倒位等结构变异,而短读长(200BP以内)在此类检测中易遗漏。
  • 临床转化加速:截至2022年底,贝瑞基因累计服务三代测序检测样本量突破10万人份,服务终端客户超1500家,其三代地贫检测效能获检验医学顶级期刊编辑部文章认可,被视为“复杂单基因病分子诊断的新机遇”。

需求结构变化:科研主导转向临床与产业双轮驱动

过去十年,三代测序市占率不足10%,应用多局限于基础科研;但近年需求结构正发生显著变化。产业端,行业巨头和初创公司纷纷布局长读长领域:illumina在2022年初宣布推出长读长产品Infinity;华大智造、Element Biosciences、Ultima Genomics等计划或已开始布局;齐碳生物在2022年完成7亿元C轮融资,成为当年国内生命科学领域一级市场最大融资之一。应用端,贝瑞基因等老牌企业持续推动三代测序的临床转化,样本量突破10万人份。这些信号表明,三代测序正从科研工具向临床诊断和产业应用扩展,需求结构从单一科研需求转向科研、临床、产业多极驱动。

常见问题

三代测序与二代测序的核心区别是什么?

二代测序(短读长)需将DNA扩增后切成不超过200BP的片段读取,再用算法拼接,对重复序列精准度低;三代测序(长读长)无需扩增,可从头到尾直接读取,最长读长可达2.4M,但当前准确率约95%,适合需要长片段完整信息的应用。

三代测序在临床中已有哪些落地案例?

截至2022年底,贝瑞基因累计服务三代测序检测样本量突破10万人份,其三代地贫检测效能获检验医学顶级期刊CLINICAL CHEMISTRY编辑部文章关注。此外,T2T联盟利用长读长技术完成首个完整人类基因组序列,验证了其在复杂基因组组装中的临床科研价值。

三代测序的投资方向如何关注?

在约投顾平台,可聚焦长读长测序技术产业化进程,关注设备制造端(如齐碳生物、PacBio、illumina等布局)、应用转化端(如贝瑞基因等临床服务商)以及上游核心耗材与数据分析环节。需求结构从科研向临床和产业扩展,为相关企业带来增量空间。

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