**基因测序行业“封闭与开放并存”的格局，是在测序仪与配套试剂形成封闭系统的同时，建库、样本预处理、测序后生信数据分析等环节逐步走向开源的过程中形成的。**其中，测序仪与配套试剂因测序原理不同而互不通用，各品牌仪器与试剂构成封闭系统；而在知识产权和专利保护作用下，行业内先发公司能够在测序试剂及耗材环节长时间赚取大量利润。这一“上游封闭、前后端开源”的结构，正是理解行业关键拐点的主线。
封闭系统的形成：仪器与试剂深度绑定
基因测序仪与配套试剂形成封闭系统，是行业格局的第一个关键节点。由于测序原理不同，每家厂商的测序仪之间，对应的测序试剂、耗材并不能通用，各品牌测序仪和测序试剂因此构成封闭系统。
以 Illumina 为例，其成立之初聚焦基因分析领域，主要产品是基因芯片，并不涉及基因测序业务；2006 年收购实验性测序仪公司 Solexa，获得边合成边测序技术，正式进军测序仪领域。收购完成后，Illumina 进行经营结构重组，利用测序和基因分型业务的协同优势，从耗材、分析工具到测序仪器实现上游市场的全覆盖。
耗材试剂由此成为封闭系统中最具商业价值的环节。根据 Illumina 的财报，平均一台 NovaSeq 系列测序仪可拉动 120 万美元左右的耗材试剂收入，且近几年其仪器收入增速已经放缓，主要增长来源就是耗材试剂收入增长；2021 年 Illumina 测序板块耗材仪器收入比例约为 4:1。
开源环节的扩散：建库与生信分析
与仪器和试剂的封闭形成对照，在建库、样本预处理、测序后生信数据分析等环节均是开源的。这一开放属性，使围绕样本处理与数据解读的工具、流程和生态得以在更广泛的参与者之间共建，也构成了行业“封闭与开放并存”的另一半。
在知识产权和专利保护的作用下，先发公司能够在测序试剂及耗材这一环节长时间赚取大量利润，而开源环节则承担了降低使用门槛、扩大应用场景的角色。两者并行，塑造了基因测序行业长期的历史格局。
国产力量的切入：自主技术体系
在封闭系统主导的格局下，国产企业通过自主技术体系切入。华大智造的技术源头来自收购的美国公司 CG，在其技术基础上完成了一系列技术和专利的完善，最终成为中国唯一、全球仅三家能够自主研发并量产临床高通量基因测序仪的企业。
其已建立自主可控的源头性核心技术体系，在基因测序领域形成以“DNBSEQ 测序技术”“规则阵列芯片技术”“测序仪光机电系统技术”等为代表的多项核心技术。其中 DNBSEQ 测序技术是华大智造基因测序仪所使用的独有的源头性核心技术，已通过形成专利实现知识产权保护。
常见问题
为什么基因测序仪和试剂是封闭系统？
因为各家测序原理不同，不同厂商测序仪所对应的测序试剂、耗材并不能通用，仪器与试剂因此构成封闭系统。这也使得耗材试剂成为厂商长期获取利润的重要环节。
哪些环节是开源的？
在建库、样本预处理、测序后生信数据分析等环节均是开源的。开源环节降低了使用门槛，与仪器试剂的封闭形成并存格局。
封闭与开放并存的格局会改变吗？
当前格局由测序原理差异与知识产权、专利保护共同决定。先发公司能够在测序试剂及耗材环节长时间赚取大量利润，而开源环节持续扩大应用生态，两者的相对关系需结合技术演进与专利环境变化持续观察。