从人类基因组计划到单例成本100美元,基因测序行业经历了两次关键拐点:第一次是以人类基因组计划完成为标志,验证了大规模测序的可行性;第二次是高通量测序技术(NGS)商用化,将成本从千万美元级拉低至100美元级,推动行业进入规模化应用时代。

第一代测序:从桑格法到人类基因组计划

基因测序的起点是1975年桑格(Sanger)和考尔森(Coulson)开创的链终止法。1977年,桑格测定了第一个基因组序列——噬菌体phiX-174,全长5375个碱基,人类由此步入基因组学时代。

第一代测序技术(Sanger法)的优点是读长可达1000bp、准确性高达99.999%,在单基因病的基因诊断和产前诊断中仍广泛应用;缺点是通量小、自动化程度低、成本高,无法支撑大规模测序。

转折点出现在2001年:以改进的Sanger法为基础,首个人类基因组计划(HGP)完成,总费用30亿美元。2003年4月14日,中、美、日、德、法、英6国科学家宣布人类基因组序列图绘制完成,人类基因序列中98%获得测定,精确度99.99%。人类基因组计划与曼哈顿原子弹计划、阿波罗计划并称为三大科学计划。

高通量测序:超摩尔定律下的成本断崖

人类基因组计划完成后,基因测序行业迎来“鸟枪换炮”的时代。高通量测序技术(High-throughput sequencing)是对传统Sanger测序的革命性改变,可一次对几百万到几十亿条核酸分子进行序列测定,因此也被称为大规模并行测序(MPS)或下一代测序技术(NGS)。

高通量测序技术诞生后,基因测序通量及成本以“超摩尔定律”(More than Moore,MtM)的速度发展。根据美国国家卫生院数据,人类全基因组测序成本出现断崖式下跌:2001年成本约9526.3万美元,2009年降至10万美元左右,2015年降至1000美元左右,2022年降至100美元。

年份人类全基因组测序成本
2001约9526.3万美元
2009约10万美元
2015约1000美元
2022约100美元

2023年2月7日,华大智造发布超高通量测序仪DNBSEQ-T20×2,每年可完成高达5万例人全基因组测序,单例成本低于100美元,为行业构筑了一款“超级测序工厂”。

常见问题

第一代测序和高通量测序的本质区别是什么?

第一代测序(Sanger法)只能分析单个DNA片段,通量小、成本高,但准确率极高;高通量测序则采用大规模并行策略,一次可测定几百万到几十亿条核酸分子,通量提升的同时成本大幅下降,代价是读长相对缩短。

人类基因组计划为什么重要?

人类基因组计划是首个完成的人类全基因组测序项目,总费用30亿美元,精确度达99.99%。它不仅验证了大规模测序的可行性,还与曼哈顿原子弹计划、阿波罗计划并称为三大科学计划,奠定了基因组学时代的基础。

单例成本100美元意味着什么?

当基因测序成本降到100美元后,基因测序的普及度将大幅度提升。基因组数据的快速积累,将使得人类基因组的解读超越生物学范畴,推动中下游诊断、健康管理等应用领域的爆发性增长。