华大智造采用的DNBSEQ技术路线（DNA纳米球与联合探针锚定聚合）具有独特优势，但基因测序行业整体仍面临技术迭代、专利纠纷、商业化及政策监管等多重风险与不确定性。
技术路线风险
华大智造的DNBSEQ技术相比其他路线增加了一个环化步骤，但官方表述为“可支持自动化”。该技术路线的读长受限于NGS技术的共性短板——NGS读长短，拼接组装难度大。这可能在需要长片段信息的应用场景（如结构变异检测、基因组组装）中构成限制。此外，测序建库过程中使用的PCR扩增环节可能引入碱基错配，尽管DNB技术通过滚环扩增实现了无损复制，但整体测序过程仍较复杂。
市场竞争与专利纠纷风险
全球基因测序设备市场长期由Illumina主导，2019年其全球市占率达74.1%，而华大智造同期为3.5%。Illumina构建了极其密集的专利网络（全球专利超12000项），并多次对同行发起专利诉讼，包括2019-2021年对华大智造针对核酸测序信号放大技术专利的诉讼。这类诉讼可能限制后进入者的发展速度。同时，以PacBio SMRT技术和Oxford Nanopore纳米孔单分子技术为代表的第三代测序技术，虽目前准确度与成本仍不及NGS，但理论上可测定无限长度核酸序列，构成潜在技术替代威胁。
商业化与政策风险
下游应用拓展存在不确定性：基因测序应用虽已覆盖基础科研、临床诊断、消费级等多个领域，但中下游企业竞争激烈，上游设备试剂端议价能力较强。此外，基因数据安全监管趋严可能影响行业扩张节奏，尤其涉及临床级应用时需满足更严格的合规要求。
常见问题
华大智造的DNB技术相比Illumina的桥式PCR技术有何主要缺点？
相比Illumina的技术路线，DNBSEQ增加了一个环化步骤，但可支持自动化。官方资料未给出两者在特定应用场景下的直接性能对比数据，具体差异需以实际测试为准。
基因测序行业的技术壁垒主要体现在哪些方面？
核心壁垒在于对测序原理的理解以及围绕测序技术构建的密集专利网络。此外，测序仪的生产制造需要集成芯片、图像系统、算法等多环节，且需通过用户使用不断打磨迭代。
第三代测序技术是否会很快取代NGS？
目前第三代测序的准确度与NGS仍有差距，单条序列错误率较高，平均成本也更高。NGS技术仍是基因测序大规模商业化应用的主要推动力，并将在未来一段时间内保持主流地位。