长读长测序技术长期由海外厂商主导，但国产自主可控的进程正在加速，核心突破集中在纳米孔测序赛道。长读长测序（即三代测序）能直接读取长片段DNA，解决二代测序（短读长）难以精准测出基因组重复序列的痛点，其价值好比“把一首歌从头唱到尾”而非切成片段再拼接。目前该领域的技术路线主要由海外两家公司主导：PacBio（荧光标记的单分子实时测序）与Oxford Nanopore Technologies（ONT）（基于电流阻断的纳米孔测序）。国产替代的进程中，齐碳生物完成7亿元C轮融资是标志性事件，同时华大智造、贝瑞基因等也在长读长领域展开布局。

长读长技术为何关键：从“切歌”到“整曲”

二代测序（NGS）需要将DNA扩增后切成不超过200BP的片段读取，再用算法还原；而三代测序（长读长）无需扩增，可从头读到尾，对测序长度原则上没有限制。用歌曲来比喻：二代测序是把《嘻唰唰》切成三字片段再复原，遇到重复序列时算法可能忽略关键信息；三代测序则能完整唱完，但代价是“容易唱错”——目前准确率仍约为95%。正因长读长能补齐短读长在重复序列、结构变异检测上的短板，国际顶级期刊《Nature Methods》曾将长读长测序评为“年度最佳技术”，科学界也利用该技术完成了首个真正完整的人类基因组序列。

国产替代进行时：融资、布局与临床转化

在产业端，国产长读长测序的追赶已现多个抓手。齐碳生物作为专注纳米孔长读长测序的初创公司，在资本寒冬中完成了金额高达7亿元的C轮融资，成为国内生命科学领域一级市场当年最大一笔融资；华大智造等厂商也已计划或开始布局长读长测序领域。在临床应用端，贝瑞基因持续发力三代测序转化，截至某时点累计服务三代测序检测样本量突破10万人份，服务终端客户超过1500家，其三代地贫检测效能曾获检验医学国际期刊编辑部文章关注，认为“三代测序技术为复杂单基因病的分子诊断带来了全新机遇”。

差距与追赶：技术成熟度与成本仍是关键

国产长读长测序与海外主导者之间的差距，主要体现在技术成熟度与成本上。海外两家的商业化起步更早：PacBio 2010年推出首款商业化机型，ONT 2015年才正式商业化，而彼时二代测序已占据最大市场份额，三代测序市占率长期不到10%，应用多局限于基础科研。国产厂商需要在读长、准确率（目前约95%）、设备便携性与成本控制上持续迭代。行业共识是单分子测序即第三代测序技术，纳米孔测序设备已实现便携化，可在极地、海洋甚至太空等复杂环境下实时测序，这为国产设备在突发疫情响应等场景提供了差异化追赶的可能。国产长读长测序能否在临床应用上实现规模化突破，仍需以技术迭代与后续第三方实测数据验证。

常见问题

长读长测序和二代测序的主要区别是什么？

二代测序（短读长）需将DNA切成不超过200BP的片段读取再算法还原；长读长测序（三代）无需扩增、从头读到尾，能更精准地检测基因组重复序列，但准确率目前约为95%，成本也相对更高。

国产长读长测序目前处于什么阶段？

国产厂商正在纳米孔测序赛道加速追赶。齐碳生物完成7亿元C轮融资，华大智造已布局长读长领域，贝瑞基因在三代测序临床应用上累计服务样本量突破10万人份。整体仍处于技术成熟度与成本追赶期。

纳米孔测序技术有什么独特优势？

纳米孔测序设备简单便携，可在极地、海洋甚至太空等复杂环境下实时测序；无需PCR扩增，可直接对DNA或RNA测序，能避免RNA逆转录引入的突变偏差，适合突发疫情等时效性要求高的场景。