长读长测序(即单分子测序,行业普遍共识将其归为第三代测序技术)正从基础科研走向临床转化,中国企业在这一全球格局中已从旁观者变为重要参与者。华大智造已明确布局长读长测序领域;齐碳生物专注纳米孔长读长路线,在2022年完成7亿元C轮融资,为当年国内生命科学领域一级市场最大单笔融资。与此同时,illumina在收购PacBio失败后于2022年初宣布推出长读长产品Infinity,Element Biosciences收购Loop Genomics,PacBio于2022年10月推出公司史上最高通量Revio长读长测序系统。全球长读长竞赛已从技术验证阶段进入产业卡位阶段,中国企业在设备制造与资本关注度上同步升温。
长读长技术为何此时升温
三代测序的核心特点是无需PCR扩增、从头读到尾,读长原则上不受限制,目前最长读长可达2.4 M,且可实时测序、设备便携、可直接对RNA测序。其短板在于准确率目前仍只能做到95%。
转折点出现在科研端:2022年4月,端粒到端粒联盟(T2T)利用长读长技术完成首个真正完整的人类基因组序列;2023年初,Nature Methods将长读长测序评选为“2022年度最佳技术”,众多科学家相信“Long-read sequencing is the future”。
全球长读长格局中的各方动向
| 领域 | 时间 | 对象 | 主要事件 |
|---|---|---|---|
| 科学界 | 2022年4月 | T2T联盟 | 利用长读长技术完成首个真正完整的人类基因组序列 |
| 科学界 | 2023年1月 | Nature Methods | 将长读长技术评选为2022年年度最佳技术 |
| 制造端 | 2022年初 | illumina | 宣布推出长读长相关产品Infinity |
| 制造端 | 2022年2月 | Element Biosciences | 收购Loop Genomics,同时提示将在原测序仪上提供短读长和长读长测序功能 |
| 制造端 | 2022年10月 | Pacific Biosciences | 宣布推出公司史上最高通量Revio长读长测序系统 |
| 投融资界 | 2022年12月 | 齐碳生物 | 完成7亿元C轮融资 |
| 应用端 | 2022年 | 贝瑞基因 | 累计服务三代测序检测样本量突破10万人份 |
在制造端,华大智造、Element Biosciences、Ultima Genomics都计划或已经开始布局长读长测序领域。在应用端,贝瑞基因持续发力三代测序的临床应用转化,截至2022年底累计服务三代测序检测样本量突破10万人份,服务终端客户超过1500家,相关工作的检测效能受到CLINICAL CHEMISTRY关注并专门发表编辑部文章。
中国企业的位置判断
从资本动向看,齐碳生物在2022年资本寒冬下完成7亿元C轮融资,为当年国内生命科学领域一级市场最大单笔,显示中国纳米孔长读长路线获得资本高度关注。从产业布局看,华大智造已进入长读长测序领域的计划或布局名单。从应用转化看,贝瑞基因在三代测序临床服务上已积累样本量与客户基础。综合来看,中国企业在全球长读长格局中处于上升位置,在设备制造、资本聚集与临床应用三个环节均有实质动作,但全球竞争格局仍在快速演变中。
常见问题
长读长测序和三代测序是什么关系?
行业普遍共识是,单分子测序技术就是第三代测序技术,而三代测序在通俗比喻中被称为长读长。所谓“第四代”多为人造的商业代际划分,业内普遍认为意义不大。
中国企业在长读长领域有哪些代表?
华大智造已布局长读长测序领域;齐碳生物专注纳米孔长读长测序,在2022年完成7亿元C轮融资;贝瑞基因持续发力三代测序临床应用转化,截至2022年底累计服务三代测序检测样本量突破10万人份。
长读长测序目前的主要短板是什么?
三代测序最大的问题是准确率目前仍只能做到95%,容易在读取时出现碱基识别错误。此外,过去十年三代测序市占率不到10%,应用多局限于基础科研,临床商业转化仍然有限。