纳米孔长读长测序的市场增长，主要由长读长、实时测序、设备便携、可直接测 RNA四项技术特性所打开的增量应用场景驱动——包括结构变异检测、病原现场测序与农业育种等方向。以 motor 蛋白牵引 DNA 或 RNA 至纳米孔、解成单链后过孔，不同碱基引起不同电流变化，再经模式识别算法确定序列，这一机制使单分子测序（即第三代测序技术）在科研、临床与现场检测中的需求持续扩张，构成市场规模增长的核心动力。
机制决定了它能做什么
纳米孔测序的原理，是将改造后的蛋白纳米孔置于人造膜上，对膜两侧施加电压差，纳米孔产生电流；当 motor 蛋白牵引 DNA 或 RNA 到纳米孔，DNA 会解开成单链，单链通过纳米孔时不同碱基导致不同的电流变化，记录电流变化并用模式识别算法即可确定碱基序列。
这套机制带来几个直接结果：文库制备简单，无需 PCR 扩增或逆转录，可直接对 DNA 或 RNA 测序；可边测序边输出结果，实现实时分析；设备形态简单便携。正是这些特性，把测序从中心实验室推向更广泛的场景。
增量场景从哪来
长读长：单分子测序原则上可检测通过纳米孔的全部核酸序列，因此对测序长度没有限制，目前最长读长可达 2.4 M。二代短读长把 DNA 扩增后切成不超过 200 BP 的片段读取再用算法还原，基因组中常见的重复序列难以精准测出；长读长“从头读到尾”，为复杂结构变异的解析提供了不同路径。
完整基因组与结构变异：端粒到端粒联盟（T2T）利用长读长技术完成了首个真正完整的人类基因组序列，补齐了人类基因组序列最后的 8%，三代测序在其中起到不可替代的作用。这类需求天然指向长读长方案。
临床转化：贝瑞基因持续发力三代测序的临床应用转化，截至 2022 年底累计服务三代测序检测样本量突破 10 万人份，服务终端客户超过 1500 家；其三代地贫检测工作受到检验医学期刊 CLINICAL CHEMISTRY 关注，该刊专门发表编辑部文章，认为三代测序技术为复杂单基因病的分子诊断带来了全新机遇。
现场与时效性场景：目前使用最成熟的 MinION 测序仪可在极地、海洋甚至太空等复杂环境下完成实时测序，可保证对突发疫情处理的时效性。此外，纳米孔测序可直接对各类形式的 RNA 测序，避免 RNA 病毒测序研究时必须逆转录为 DNA 扩增所产生的偏向性及可能引入的突变。
产业端的印证
制造端与资本端的动作，从侧面反映了这条路线受到的关注：illumina 在 2022 年初宣布将推出长读长产品 Infinity，外界普遍猜测其将采用合成长读长方式；Element Biosciences 收购 Loop Genomics 并提示将在原测序仪上提供短读长和长读长功能；Pacific Biosciences 于 2022 年 10 月推出公司史上最高通量 Revio 长读长测序系统；华大智造、Ultima Genomics 也计划或已开始布局长读长领域。投融资方面，专注纳米孔长读长测序的齐碳生物在 2022 年 12 月完成 7 亿元 C 轮融资。2023 年初，Nature Methods 将长读长测序（三代测序）评选为“2022 年度最佳技术”。
需要说明的是，三代测序目前准确率仍只能做到 95%，过去十年市占率不到 10%，应用多局限于基础科学研究，临床商业转化相对有限——增长驱动成立的同时，这一约束同样真实存在。
常见问题
纳米孔测序为什么能实现长读长？
因为它利用碱基穿过纳米孔时电信号的改变实现测序，原则上可检测通过纳米孔的全部核酸序列，因此对测序长度没有限制，目前最长读长可达 2.4 M。
这项技术最直接拉动哪些场景的需求？
主要是需要长读长、实时性和现场部署能力的方向，例如完整基因组与复杂结构变异解析、病原现场测序、复杂单基因病的分子诊断，以及可直接对 RNA 测序的相关研究。
市场规模增长是否意味着三代测序已取代二代？
并非如此。三代测序目前准确率仍只能做到 95%，过去十年市占率不到 10%，应用多集中于基础科研；二代短读长在成本与通量上仍有其位置，两者更多是场景互补关系，具体格局需以第三方公开数据为准。