纳米孔测序的技术原型确实可以追溯到1996年PNAS发表的“用膜通道检测多核苷酸序列”一文，但行业公认的关键拐点并不在论文发表之时，而在于商业化落地与临床价值被验证的节点。按行业普遍共识，单分子测序即第三代测序技术，其两条路线分别以PacBio和Nanopore为代表；Oxford Nanopore Technologies（ONT）于2005年从英国牛津大学衍生并独立运营，2012年在AGBT会议上展示首款掌上测序仪MinION，2015年才正式开始商业化。真正让长读长测序从“实验室工具”走向“行业焦点”的，是2022年端粒到端粒联盟（T2T）利用长读长技术完成首个真正完整的人类基因组序列，以及2023年初Nature Methods将长读长测序评选为“2022年度最佳技术”。
从论文到公司：原型期为何漫长
纳米孔测序的技术原型可追溯至1996年PNAS那篇用膜通道检测多核苷酸序列的文章，但此后近十年才出现独立运营的主体。2005年，ONT从牛津大学衍生出来，开始独立运营。同一时期，三代测序的另一条路线也在推进：2000年PacBio前身Nanofluidics, Inc.在美国加州成立，2003年Science以封面形式发表零模波导ZMW的最初模型文章。
值得注意的是，三代测序的起步甚至早于很多人的印象，但在很长时间里并未撼动二代测序的地位。
商业化节奏：真正的分水岭
从时间线看，技术展示与正式商业化之间存在明显时滞。PacBio第一款商业化机型PacBioRS直到2010年才推向市场；ONT在2012年AGBT会议上展示首款掌上测序仪MinION，其后到2015年才开始正式商业化。而此时以illumina为代表的二代测序已占据最大市场份额，并在科研和临床市场密集推出多款机型。
因此，行业关键拐点更应理解为**“长读长测序的独特价值被权威科学事件确认”的时刻**，而非某一台仪器发布。
拐点确认：T2T与年度技术
2022年4月，Science连发6篇文章，报道T2T联盟完成的首个真正完整的人类基因组序列，这是人类基因组计划发起30年后又一重大里程碑事件；为补齐人类基因组序列最后的8%，三代测序起到了不可替代的作用。2023年初，Nature Methods将长读长测序评选为“2022年度最佳技术”。
产业端同步出现布局信号：illumina于2022年初宣布推出长读长相关产品Infinity；Element Biosciences、Pacific Biosciences、华大智造、Ultima Genomics等亦有布局或产品动作；齐碳生物完成7亿元C轮融资；贝瑞基因截至2022年底累计服务三代测序检测样本量突破10万人份，服务终端客户超过1500家。
常见问题
纳米孔测序的技术原型最早出现在什么时候？
可追溯至1996年PNAS发表的“用膜通道检测多核苷酸序列”一文。但原型论文与商业化之间相隔多年，ONT直到2005年才从牛津大学衍生并独立运营。
纳米孔测序的关键拐点是哪一年？
若以“科学界公认长读长价值”为口径，2022年T2T完成首个真正完整的人类基因组序列、2023年初Nature Methods将其评为“2022年度最佳技术”，是更具标志性的节点。若以“产品正式商业化”为口径，ONT的MinION在2015年才开始正式商业化。
三代测序和二代测序是什么关系？
行业普遍共识是单分子测序即第三代测序技术。二代测序被称为短读长，三代测序被称为长读长；三代无需扩增、可从头读到尾，但准确率目前仍只能做到95%，过去十年市占率不到10%，应用多局限于基础科研。