三代单分子实时测序(即单分子测序,行业普遍共识将其归为第三代测序技术)的核心价值在于:无需PCR扩增或逆转录即可直接测序,可边测序边输出结果并实现数据的实时分析。这一特性使其能够直接测定各类形式的RNA,避免RNA病毒测序时逆转录为DNA扩增所产生的偏向性及可能引入的突变,从而在临床快速检测与RNA病毒研究等场景中形成差异化的需求驱动。需要说明的是,具体市场增长空间尚无统一口径,需以官方后续公布及第三方实测为准。

实时能力为何构成新的需求驱动

传统二代测序的文库构建复杂繁琐、测序读长短、序列分析时间长。相比之下,单分子测序的文库制备过程简单,无需对样品中核酸进行PCR扩增或逆转录,可直接对DNA或RNA测序,并且能够边测序边输出结果。这种"边测边出"的实时分析能力,缩短了从样本到结果的链路,对时效性要求高的场景具有直接吸引力。

在设备层面,纳米孔测序设备简单便携,目前使用较成熟的MinION测序仪可在极地、海洋甚至太空等复杂环境下完成实时测序,可保证对突发疫情处理的时效性。

RNA病毒研究与临床检测的差异化增长点

资料明确指出,纳米孔测序可以直接对各类形式的RNA进行测序,能避免目前对RNA病毒进行测序和研究时必须将RNA逆转录为DNA扩增所产生的偏向性及可能引入的突变。这意味着在RNA病毒研究中,测序结果更贴近样本原始状态,减少了逆转录环节带来的信息失真,构成区别于传统路径的差异化能力。

在临床应用转化端,产业界对三代测序的投入正在增加。据官网信息,截至2022年底,贝瑞基因累计服务三代测序检测样本量突破10万人份,服务终端客户超过1500家;检验医学顶级国际期刊CLINICAL CHEMISTRY专门发表编辑部文章,认为"三代测序技术为复杂单基因病的分子诊断带来了全新机遇,拥有巨大价值及广阔前景"。

产业端关注度持续升温

制造端方面,illumina在2022年初宣布将推出自己的长读长产品Infinity;Element Biosciences、Pacific Biosciences等企业也在长读长方向持续布局。投融资端,齐碳生物(纳米孔测序)在2022年12月完成7亿元C轮融资。科学界层面,2022年4月端粒到端粒联盟(T2T)利用长读长技术完成首个真正完整的人类基因组序列;2023年1月,Nature Methods将长读长技术评选为"2022年年度最佳技术"。

常见问题

单分子实时测序可以直接测RNA吗?

可以。单分子测序无需对样品中核酸进行PCR扩增或逆转录,可直接对DNA或RNA进行测序,并能避免对RNA病毒测序时必须逆转录为DNA扩增所产生的偏向性及可能引入的突变。

实时输出结果对哪些场景最有价值?

对时效性要求高的场景价值突出,例如突发疫情处理。纳米孔测序设备简单便携,较成熟的MinION测序仪可在极地、海洋甚至太空等复杂环境下完成实时测序。

三代测序目前的市场地位如何?

资料显示,在过去十年中三代测序市占率不到10%,应用多局限于基础科学研究。但情况正在变化,产业端布局、投融资及科学界认可度均在提升,具体市场增长空间需以官方后续公布及第三方实测为准。