第一代基因测序技术（以 Sanger 法为代表）的准确率高达 99.999%、读长可达 1000bp，且基本适用于所有突变类型，因此在单基因病的基因诊断与产前诊断中仍被广泛采用。它之所以不可替代，核心原因在于：其单片段读取的高准确度与对已知/未知突变的普适性，恰好匹配临床确诊与验证环节对结果可靠性的要求；而通量小、依赖 PCR 扩增、自动化程度低、成本高等特点，则使其让位于高通量测序在大规模全基因组层面的应用。
为什么准确率与读长决定了它的临床地位
第一代测序的突出优势集中在结果质量上：假条带出现减少、结果更清楚，读取长度较长，且因掺入同位素标记的三磷酸，末端终止法可测更小序列的核苷酸链。这些特性使其基本适用于所有突变类型，准确率几乎 100%。在单基因病的基因诊断和产前诊断中，这类对单点、单片段结果高度敏感的场景，正是其价值所在。
产业链视角：上游试剂与设备是核心壁垒
从产业链看，第一代测序的落地依赖两个上游环节：一是 PCR 扩增试剂，因为该技术离不开 PCR 扩增，且只能分析单个 DNA 片段；二是毛细管电泳等配套检测设备。中游为测序服务与数据分析，下游则集中于单基因病诊断和产前诊断等临床场景。上游的聚合酶与电泳设备，构成了这一技术路线的核心壁垒。
为何在全基因组测序中被替代
第一代测序的短板同样明确：通量小，不能进行基因组层面的分析；自动化程度低，检测速度慢，对某些需要快速检测的疾病不适合；成本高，不适用于大规模测序。相比之下，高通量测序可一次对几百万到几十亿条核酸分子进行序列测定，并在成本上以“超摩尔定律”的速度下行。因此，在全基因组大规模测序领域，第一代技术被高通量测序取代；但在临床确诊与结果验证环节，其高准确度仍不可替代。
常见问题
第一代测序和 Sanger 测序是一回事吗？
第一代 DNA 测序技术指 1975 年由桑格和考尔森开创的链终止法，以及 1976—1977 年由马克西姆和吉尔伯特发明的化学法。Sanger 所使用的双脱氧链终止法即链终止法，是其中最具代表性的一条技术路线。
既然准确率几乎 100%，为什么不做全基因组测序？
因为它离不开 PCR 扩增，且只能分析单个 DNA 片段，通量小，无法进行基因组层面的分析，同时自动化程度低、成本高，不适用于大规模测序。全基因组层面的工作，由可并行读取海量片段的高通量测序承担。
它在临床上主要用在哪里？
主要集中于单基因病的基因诊断和产前诊断。其可用于未知或已知突变的检测，更容易实行，且基本适用于所有突变类型，因此在需要高可靠结果的确认环节被广泛采用。