长读长测序竞争加剧，illumina的Infinity与PacBio、ONT在基因测序格局中会形成怎样的龙头卡位？

长读长测序赛道正从PacBio与ONT的双雄格局，演变为三方角力：PacBio与ONT分别以荧光单分子与纳米孔电流两条天然长读长路线长期深耕，illumina在收购PacBio失败后，于2022年初宣布推出长读长产品Infinity，外界普遍猜测其将采用合成长读长这一变通方式切入。 三方并非简单的替代关系，而是围绕技术路线、读长能力与临床转化形成差异化卡位，行业龙头地位面临重新梳理。

两条天然路线：PacBio与ONT的技术分野

单分子测序有两条技术路线，按碱基的荧光信号或电流阻断来识别序列，分别对应PacBio技术与Nanopore技术。PacBio将荧光标记的碱基与待测序列、DNA聚合酶一并放入纳米孔底部，通过荧光信号时间差异识别碱基；ONT则改造蛋白通道构成纳米孔，利用不同碱基通过时产生的电流变化，结合模式识别算法确定序列。

两条路线在应用上各有落点。单分子测序原则上对读长没有限制，目前最长读长可达2.4 M，且无需PCR扩增即可直接测序，可边测序边输出结果；纳米孔设备简单便携，MinION测序仪已在极地、海洋甚至太空等复杂环境下完成实时测序。ONT的Nanopore技术有时被称为第四代测序，但业内普遍观点认为这一代际属人造的商业划分，行业共识仍是单分子测序即第三代测序。

illumina的合成长读长：Infinity的卡位逻辑

illumina凭借二代测序系统的出色性能，迅速攻占科研和临床市场，最终占据最大市场份额。但在长读长方向，其收购PacBio未能成行，探索并未停止，2022年年初宣布将推出长读长产品Infinity。与PacBio、ONT的天然长读长不同，外界普遍猜测Infinity将采用合成长读长测序技术。

这一路径的差异决定了卡位逻辑：天然长读长以单分子直接读取见长，而合成长读长更可能依托既有短读长体系做延伸。长读长赛道并非只有这三家，华大智造、Element Biosciences、Ultima Genomics均计划或已开始布局，Element Biosciences于2022年2月收购Loop Genomics，并提示将在原测序仪上提供短读长与长读长测序功能。

格局变量：临床转化与资本关注

长读长技术正获得科学界与产业界的双重背书。2022年4月，端粒到端粒联盟（T2T）利用长读长技术完成首个真正完整的人类基因组序列，补齐了人类基因组序列最后的8%；2023年初，Nature Methods将长读长测序评选为“2022年度最佳技术”，众多科学家相信“Long-read sequencing is the future”。

产业端的进展同样密集。PacBio于2022年10月宣布推出公司史上最高通量Revio长读长测序系统；应用端，贝瑞基因据官网信息，截至2022年底累计服务三代测序检测样本量突破10万人份，服务终端客户超过1500家，其三代地贫检测效能获检验医学期刊CLINICAL CHEMISTRY专门发表编辑部文章关注。投融资方面，专注纳米孔长读长测序的齐碳生物在2022年12月完成7亿元C轮融资。

常见问题

Infinity与PacBio、ONT的技术路线有何本质区别？

PacBio与ONT属于天然长读长，分别基于荧光信号与纳米孔电流直接读取单分子序列；Infinity则被外界普遍猜测采用合成长读长这一变通方式。三者路线不同，决定了各自在读长表现与体系兼容性上的定位差异，具体性能需以后续公开数据与第三方实测为准。

长读长测序当前的市场处境如何？

过去十年三代测序市占率不到10%，应用多局限于基础科学研究，临床商业转化寥寥。但随着T2T完整人类基因组序列的完成与Nature Methods的年度技术评选，加上贝瑞基因等企业在临床转化上的推进，长读长正迎来新的突破窗口。

长读长赛道的竞争主体是否只有这三家？

并非如此。除illumina、PacBio、ONT外，华大智造、Element Biosciences、Ultima Genomics均计划或已开始布局，齐碳生物等专注纳米孔路线的初创公司也获得资本关注。赛道呈现多方入局、路线并行的态势，龙头卡位仍处于动态演变之中。