长读长基因测序的关键拐点，是一条从技术原型走向产业落地、再走向完整基因组应用的演进路径。2003年Science以封面形式发表零模波导ZMW最初模型，为PacBio单分子实时测序奠定核心单元；2005年Oxford Nanopore（ONT）从牛津大学衍生独立运营，其纳米孔技术原型可追溯至1996年PNAS论文；2010年PacBio首款商业化机型PacBio RS推向市场；2022年4月端粒到端粒联盟（T2T）利用长读长技术完成首个真正完整的人类基因组序列，补齐了最后的8%。 行业普遍共识是，单分子测序技术即第三代测序技术，也就是通常所说的长读长。

从论文到公司：两条技术路线的起点

2000年，PacBio的前身Nanofluidics, Inc.在美国加州成立。2003年，Science杂志以封面形式发表《Zero-Mode Waveguides for Single-Molecule Analysis at High Concentrations》，这是PacBio单分子实时测序核心单元零模波导ZMW的最初模型。

另一条路线起步同样很早。2005年，ONT从英国牛津大学衍生出来，开始独立运营；其纳米孔测序的技术原型可追溯到1996年PNAS发表的文章《用膜通道检测多核苷酸序列》。两条路线分别以荧光信号与电流阻断识别碱基，构成单分子测序的主要技术分支。

商业化落地：从样机到市场

技术原型与商业产品之间存在明显时差。直到2010年，PacBio第一款商业化机型PacBio RS才推向市场；ONT则到2012年AGBT会议才展示第一款掌上测序仪MinION，其后到2015年才开始正式商业化。

这一时期，以illumina为代表的二代测序正处强势地位，密集推出多款机型，凭借测序系统性能迅速攻占科研和临床市场。三代测序则因准确率限制，在过去十年市占率不到10%，应用多局限于基础科学研究。

完整基因组：长读长的里程碑

2022年4月，Science杂志连发6篇文章，报道T2T联盟完成的首个真正完整的人类基因组序列，这是人类基因组计划发起30年后的又一重大里程碑，三代测序在补齐最后8%序列中起到了不可替代的作用。2023年初，Nature Methods将长读长测序评选为“2022年度最佳技术”。

产业端同步升温：illumina宣布推出长读长产品Infinity；Element Biosciences收购Loop Genomics；Pacific Biosciences推出Revio长读长测序系统；齐碳生物完成7亿元C轮融资；贝瑞基因截至2022年底累计服务三代测序检测样本量突破10万人份，服务终端客户超过1500家。

常见问题

长读长和短读长的核心区别是什么？

二代测序即短读长，需将DNA扩增后切成不超过200BP的片段读取，再用算法还原；三代测序即长读长，不用扩增，从头读到尾。前者难以精准测出基因组中常见的重复序列，后者则能覆盖这类区域。

为什么说2022年T2T完整基因组是重要拐点？

T2T联盟利用长读长技术完成了首个真正完整的人类基因组序列，补齐了此前未能测定的最后8%。这是人类基因组计划发起30年后的里程碑事件，也直接推动长读长测序在次年获评“2022年度最佳技术”。

三代测序目前的准确率如何？

三代测序无需扩增、读长更长，但当前准确率仍只能做到95%，存在把“嘻唰唰”唱成“喜剧刷”式的错误风险。这也是其过去十年市占率不到10%、应用多集中于基础科研的原因之一。