长读长基因测序需求正在快速增长,但长期以来供给方仅有PacBio和ONT,产能有限。Illumina入局长读长测序领域,有望凭借其规模化生产能力大幅增加市场供给,从而缓解供需矛盾,并可能降低价格、刺激更多下游应用。

长读长测序需求为何增长

长读长测序(即三代测序)因其能够“从头读到尾”的技术特点,在基因组组装、结构变异检测等领域具有不可替代的优势。2022年4月,端粒到端粒联盟(T2T)利用长读长技术完成了首个真正完整的人类基因组序列;2023年初,国际顶级期刊《Nature Methods》将长读长测序评选为“2022年度最佳技术”,科学界普遍认为“Long-read sequencing is the future”。在应用端,截至2022年底,贝瑞基因累计服务三代测序检测样本量已突破10万人份,显示出临床转化正在加速。

Illumina Infinity的供给扩容潜力

Illumina在收购PacBio失败后,于2022年初宣布推出自己的长读长产品Infinity。外界普遍猜测,Infinity采用合成长读长测序技术,而非PacBio和ONT的天然长读长路线。作为二代测序市场的绝对主导者,Illumina拥有成熟的规模化生产体系和庞大的装机基础,其入局有望显著扩大长读长测序的供给规模,改变此前供给方单一、产能有限的局面。

常见问题

长读长测序与短读长测序的核心区别是什么?

短读长测序(二代测序)将DNA切成不超过200BP的片段读取,再用算法还原;长读长测序(三代测序)无需扩增,直接从头读到尾。长读长能精准测出基因组中重复序列,而短读长在此类区域容易出错。

Illumina Infinity与PacBio、ONT的技术路线有何不同?

PacBio和ONT采用天然长读长测序技术,基于单分子电信号或化学反应信号检测。而Illumina Infinity据外界推测采用合成长读长测序技术,这是一种变通方式,可能更易于与Illumina现有的短读长平台整合并规模化生产。

长读长测序的准确率如何?

目前长读长测序的准确率仍只能做到约95%,存在“唱错”的问题。不过随着技术迭代和更多厂商入局,准确率有望持续提升。

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