桥式PCR扩增路线长期由Illumina等海外企业主导并构建了密集的专利网,但该技术本身存在PCR扩增导致的错误累积问题。国内厂商绕开这一路径的关键,在于采用完全不同的扩增与测序原理——华大智造以DNA纳米球与联合探针锚定聚合相结合的技术路线(DNBSEQ)实现了自主可控,从原理上绕开桥式PCR的专利壁垒与错误累积

桥式PCR的局限:错误累积与专利壁垒

桥式PCR扩增与边合成边测序结合的技术路线,是Illumina的核心技术类别。该路线的技术缺点明确:PCR扩增技术会导致错误累积,搭配的生化技术还会产生标签跳跃(Index Hopping)问题,需要使用双接头弥补。这意味着依赖桥式PCR的测序平台在建库扩增环节会引入碱基错配,且该错误会随扩增循环累积。

与此同时,测序技术的核心壁垒不仅在于对测序原理的理解,更在于围绕技术构建的专利网。Illumina作为全球基因测序仪领域的领导者,专利布局极其密集,并多次对同行发起专利诉讼,包括对华大智造发起针对核酸测序信号放大技术专利的诉讼。在新进入者难以突破存量专利网络的背景下,只能通过独创技术、彻底与原有技术路线区分开来

DNBSEQ的替代路径:滚环扩增与DNA纳米球

华大智造的技术路线绕开了桥式PCR,其核心流程为:先将待测DNA碎片化并添加接头,环化得到单链环状DNA;随后通过滚环扩增进行无损复制并形成DNA纳米球;再将DNA纳米球固定在阵列化测序芯片上,通过联合探针锚定聚合技术读取碱基序列。

这一技术路线的优势体现在官方对比中:检测准确性高,同时产出数据重复序列率低,能有效减少数据浪费;通量覆盖广,不同测序仪器机型的单机单次运行测序通量范围为0.25-72000Gb。相比桥式PCR路线,DNBSEQ以滚环扩增替代PCR扩增,从原理上规避了错误累积问题,也无需依赖桥式PCR相关的专利体系。其技术缺点仅为相比其他产品增加了一个环化步骤,但该步骤可支持自动化。

国产替代的现实格局

从市场格局看,基因测序设备及耗材市场主要被Illumina等海外龙头占据,以销售额计,2019年Illumina全球市占率为74.1%,中国市占率为61%;华大智造全球市占率为3.5%,中国市占率为24%。上游设备制造领域集多种交叉学科于一体且研发周期长,技术壁垒高,新进入者即便拥有专利和早期技术,也未必能直接转化出量产且成功的基因测序仪,仍需通过与使用者的磨合来打磨和迭代产品。

常见问题

桥式PCR的错误累积具体指什么?

桥式PCR扩增属于PCR扩增技术,在扩增过程中可能错配碱基,且错误会随扩增循环累积。相比之下,华大智造的DNBSEQ路线采用滚环扩增进行无损复制,从扩增原理上规避了这一缺陷。

华大智造的DNBSEQ与Illumina的桥式PCR有何本质区别?

两者是并列的NGS测序技术路线。桥式PCR依赖PCR扩增与边合成边测序结合,而DNBSEQ采用DNA纳米球与联合探针锚定聚合相结合的技术路线,通过滚环扩增形成DNA纳米球,再固定在测序芯片上进行测序,扩增原理和信号读取方式均不同。

国产测序仪在通量上是否具备竞争力?

华大智造不同测序仪器机型的单机单次运行测序通量范围为0.25-72000Gb,通量覆盖广,且产出数据重复序列率低,能有效减少数据浪费。具体机型的性能表现需结合官方公布及第三方实测数据综合评估。