Sanger测序依赖PCR扩增且成本高昂，在基因测序的成本结构中，它仅在特定高精度验证场景中保持经济性，并不适用于大规模测序。其单碱基成本远高于高通量测序（NGS），但凭借高达99.999%的准确性和1000bp的读长，在单基因病诊断、产前诊断等需要极高精度的验证环节中，依然具有不可替代的价值和利润空间。
成本结构：固定与变动成本拆解
Sanger测序的成本主要由两部分构成：
- 固定成本：设备折旧（包括毛细管电泳仪等）和实验室基础设施维护，这部分在小型验证实验室中分摊有限。
- 变动成本：试剂（如双脱氧核苷酸、引物）、PCR扩增耗材和人工操作费用。由于自动化程度低、检测速度慢，人工成本在总成本中占比较高，且每个反应仅能分析单个DNA片段，通量小。
相比之下，NGS通过大规模并行测序，将单碱基成本压至极低水平。例如，人类全基因组测序成本已从2001年的近1亿美元降至2023年的低于100美元。这使得Sanger测序在常规筛查和大规模项目中完全失去成本优势。
验证场景：高附加值服务中的利润空间
Sanger测序的经济性体现在其作为“金标准”的验证角色：
- 准确性99.999%：基本适用于所有突变类型，假条带少，结果清晰，是NGS结果验证的首选方法。
- 读长1000bp：可覆盖较长的DNA片段，适合检测复杂结构变异。
- 应用场景：在单基因病的基因诊断、产前诊断、法医鉴定等需要法律级精度的场景中，客户愿意为高可信度支付溢价。每例验证服务收费远高于其变动成本，形成稳定的利润空间。
常见问题
Sanger测序是否会被NGS完全取代？
不会。NGS在大规模测序中成本优势显著，但在高精度验证场景（如临床诊断中的突变确认）中，Sanger测序的准确性和读长仍是不可替代的“金标准”。
Sanger测序的“PCR依赖”如何影响成本？
PCR扩增是Sanger测序的必要步骤，每个反应需单独扩增，导致试剂和人工成本随样本数线性增长。这限制了其通量，但在验证少量关键位点时，成本可控。
Sanger测序在基因测序产业链中处于什么位置？
它主要服务于中下游应用企业的验证环节，如精准医疗公司的NGS结果复核、法医实验室的亲子鉴定等，是产业链中高附加值、低通量但不可或缺的一环。