单分子测序（第三代测序）的单次运行平均成本确实高于成熟的 NGS，但其成本结构并非“全面更贵”，而是高度集中在设备摊销与高值耗材两端，数据分析成本占比相对可控。对基因测序企业而言，重塑盈利模式的关键不在于与 NGS 拼单碱基价格，而在于将单分子长读长、无 PCR 扩增的技术特性转化为差异化服务能力，通过面向科研与临床的不同定价策略，以及高附加值应用开发，构建不依赖单位成本下降的可持续盈利模型。

单分子测序的成本构成拆解

从成本结构看，单分子测序与 NGS 的差异主要体现在三个层面：

  • 设备摊销：单分子测序仪（如 PacBio Sequel 系列、ONT PromethION）单台购置成本高，且技术迭代快，设备折旧在单位成本中占比显著。
  • 耗材成本：芯片/flow cell 是单分子测序的核心耗材，其单价远高于 NGS 的常规测序芯片，且单次有效数据产出受制于芯片上纳米孔或零模波导孔的密度。
  • 数据分析与存储：单分子测序产生的原始数据量大，但错误率较高（单条序列错误率高于 NGS），需要额外的计算资源进行纠错和组装，不过该部分成本占比通常低于设备和耗材。

盈利模式重塑：从“卖通量”到“卖解决方案”

单分子测序平均成本较高，意味着单纯依靠“低价走量”的 NGS 商业模式难以复制。可行的路径是：

  • 差异化定价：针对需要长读长、无 GC 偏好性、可直接检测甲基化等修饰的科研应用场景，按“项目价值”而非“碱基数量”定价，例如全基因组完成图、结构变异检测、复杂基因组组装等。
  • 高附加值应用开发：聚焦 NGS 难以解决的应用痛点，如染色体结构变异、串联重复序列、单倍型分型等，这些应用对读长要求高，客户对价格敏感度相对较低。
  • 临床客户转向“报告付费”：面向临床客户，将测序服务打包为“测序+分析+解读”的一体化报告，而非仅出售原始数据。

常见问题

单分子测序的成本劣势是永久性的吗？

并非绝对。随着芯片密度提升和耗材工艺成熟，单分子测序的单位成本仍在下降通道中，但目前阶段其成本仍高于 NGS，且未来降本速度需以厂商后续公布的技术路线图和第三方实测数据为准。

中游测序服务商应如何应对设备折旧压力？

核心策略是提高设备利用率。通过承接多样化的科研和临床项目，减少设备闲置；同时可考虑与上游厂商合作，探索“按需付费”或“服务换数据”的灵活采购模式，而非一次性重资产投入。

面向科研客户和临床客户的定价策略有何不同？

科研客户更看重数据质量和完整性，可采取“项目制+增值分析”定价；临床客户更关注结果稳定性和交付周期，适合“套餐制+报告解读”的打包定价，并将质量控制成本纳入报价体系。