T2T基因组计划让长读长测序(三代测序)成为行业焦点,基因测序监管政策预计将从以二代测序(NGS)为主导,逐步转向兼顾并鼓励三代长读长技术临床转化的审慎平衡路径。长读长测序已获国际权威认可,但在准确率瓶颈尚未完全解决前,监管将在鼓励创新与保障检测可靠性之间寻找平衡点。

技术跃迁:从“拼图”到“通读”

二代测序(NGS)需将DNA扩增后切成不超过200BP的片段读取,再用算法还原,对基因组中常见的重复序列难以精准测出。而三代测序(单分子测序)无需PCR扩增,可从头读到尾,理论上对测序长度没有限制。2022年4月,端粒到端粒联盟(T2T)利用长读长技术完成了首个真正完整的人类基因组序列,补齐了此前缺失的最后8%;2023年初,国际顶级期刊Nature Methods将长读长测序评选为“2022年度最佳技术”。这一里程碑意味着,三代测序在解决复杂基因组结构变异方面的独特价值已获科学界公认。

监管转向:审慎鼓励临床转化

随着三代测序从基础研究走向临床应用,监管思路正呈现“审慎鼓励”的态势。在产业端,测序应用领域的代表性企业贝瑞基因持续发力三代测序临床应用转化,其三代地贫检测效能受到检验医学国际期刊CLINICAL CHEMISTRY关注,该刊发表编辑部文章认为“三代测序技术为复杂单基因病的分子诊断带来了全新机遇”。这表明监管与学术评审体系对三代技术的临床价值正给予更多关注。

然而,监管转向并非一蹴而就。三代测序目前准确率仍存在瓶颈,且设备便携、实时测序等优势与数据安全、伦理审查等维度的合规要求需要统筹平衡。可以预见,政策将在鼓励技术创新的同时,对临床应用的准确率验证、数据管理提出更细化的要求,短期内更可能形成二代与三代技术互补并存的审评格局

常见问题

三代测序会取代二代测序吗?

不会。三代测序读长长、可实时测序,但准确率仍有瓶颈;二代测序通量高、成本低、生态成熟。两者在临床应用中更可能形成互补,监管层面也会依据不同应用场景分别制定审评标准。

长读长测序的临床转化进展如何?

已在部分复杂单基因病领域取得突破。例如贝瑞基因的三代地贫检测获得国际期刊关注,截至2022年底其累计服务三代测序检测样本量已突破10万人份,显示出临床应用的初步规模。

监管政策最关注三代测序的哪些问题?

主要关注三点:一是检测准确率能否达到临床诊断标准;二是数据安全与隐私保护机制是否健全;三是伦理审查是否覆盖新型检测技术的应用场景。这些维度将决定政策开放的节奏与力度。

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