2022年4月，端粒到端粒联盟（T2T）在《Science》杂志连发6篇文章，宣布完成首个真正完整的人类基因组序列，补齐了此前人类基因组计划遗留的最后8%。这一里程碑的实现，离不开以长读长为核心的第三代测序技术，它正深刻重塑基因测序产业链上下游的格局。
三代测序如何突破瓶颈
二代测序（短读长）将DNA扩增后切成不超过200BP的片段读取，再用算法还原，但难以精准测出基因组中常见的重复序列。三代测序（长读长）则无需扩增，从头读到尾，最长读长可达2.4M，能直接跨越重复区域，因此成为补齐最后8%序列的关键工具。2023年初，国际顶级期刊《Nature Methods》将长读长测序评选为“2022年度最佳技术”，认为“Long-read sequencing is the future”。
产业链上下游格局变化
上游：仪器与试剂供应商加速布局
三代测序的两条技术路线——PacBio（荧光信号）和Oxford Nanopore（电信号）——在上游占据核心位置。行业巨头illumina在2022年初宣布推出长读长产品Infinity；华大智造、Element Biosciences等也计划或已开始布局长读长领域。纳米孔测序设备小巧便携，如MinION可在极地、海洋等复杂环境实时测序，拓展了应用场景。
中游：测序服务商临床转化提速
测序应用领域老牌选手贝瑞基因持续发力三代测序的临床应用转化。截至2022年底，其累计服务三代测序检测样本量突破10万人份，服务终端客户超过1500家。这一工作得到检验医学顶级期刊《CLINICAL CHEMISTRY》的编辑部文章关注，认为“三代测序技术为复杂单基因病的分子诊断带来了全新机遇”。
下游：数据解读与AI分析迎来新挑战
长读长测序产生的海量长片段数据，对生物信息学分析和AI算法提出更高要求。同时，由于三代测序可直接对RNA进行测序，避免了逆转录扩增的偏向性，为病毒研究与转录组分析开辟了新路径。
常见问题
三代测序与二代测序的主要区别是什么？
二代测序是短读长，将DNA切成不超过200BP的片段读取后算法还原；三代测序是长读长，无需扩增，从头到尾直接读取一条完整的DNA分子。三代测序能精准检测重复序列和结构变异，但准确率目前仍有提升空间。
三代测序在T2T基因组项目中扮演了什么角色？
T2T联盟利用长读长技术（三代测序）完成了首个真正完整的人类基因组序列，补齐了此前无法测序的8%区域。三代测序的长读长能力是跨越基因组重复区域、实现端粒到端粒完整组装的核心工具。
目前哪些公司在布局三代测序？
上游仪器方面包括PacBio、Oxford Nanopore，以及宣布推出长读长产品的illumina；中游应用端以贝瑞基因为代表，已累计服务三代测序检测样本量突破10万人份；此外，初创公司齐碳生物（纳米孔测序）在2022年完成了7亿元C轮融资。