零模波导(ZMW)作为单分子实时测序的核心单元,使长读长测序读长可突破2.4M,但供给端规模化瓶颈的打开,取决于ZMW芯片制造精度与通量爬坡的节奏,以及PacBio、ONT两大厂商扩产计划的落地进度。目前长读长测序供给正处于从“科研工具”向“规模化应用”过渡的关键阶段,未来2-3年将是供给放量的重要观察窗口——这一判断基于PacBio于2022年推出公司史上最高通量的Revio长读长测序系统、ONT自2015年商业化以来持续迭代等产业事实。

技术原点:ZMW如何实现长读长

PacBio技术将荧光标记的不同碱基与待测序列、DNA聚合酶一同放入纳米孔底部,每个纳米孔(即零模波导ZMW)只允许一条DNA模板进入,通过荧光信号时间的不同识别碱基序列。这一技术原型最早于2003年以封面文章形式发表于Science杂志,是PacBio单分子实时测序的核心单元。由于单分子测序原则上可检测通过纳米孔的全部核酸序列,对测序长度没有限制,目前最长读长可达2.4M——这正是长读长测序区别于二代短读长(不超过200BP片段读取)的根本优势。

供给端演进:从商业化起步到通量跃升

长读长测序的供给扩张经历了清晰的阶段性节点:

时间节点厂商/机构关键事件
2003年PacBio前身ZMW原型发表于Science封面
2010年PacBio首款商业化机型PacBioRS推向市场
2015年ONTMinION正式商业化
2022年10月PacBio推出公司史上最高通量Revio长读长测序系统
2022年12月齐碳生物完成7亿元C轮融资(国内生命科学领域当年最大一笔一级市场融资)

从这一时间线可以看出,从ZMW原型发表到首款商业化机型问世用了7年,从首款机型到更高通量系统又用了12年。供给端的核心瓶颈在于ZMW芯片的制造精度——纳米孔阵列的均一性、DNA聚合酶与模板结合效率、荧光信号采集的灵敏度,都直接决定通量上限与单碱基成本。 2022年Revio系统的推出标志着PacBio在通量维度的重要跃升,而ONT的纳米孔技术路线则通过蛋白通道电流检测实现测序,设备小型化(MinION可在极地、海洋等复杂环境使用)是其差异化优势。

需求端催化:长读长从边缘走向主流

供给放量的另一侧是需求端的持续升温。2022年4月,端粒到端粒联盟(T2T)利用长读长技术完成了首个真正完整的人类基因组序列,补齐了此前缺失的8%;2023年初,Nature Methods将长读长测序评选为“2022年度最佳技术”。在应用端,贝瑞基因截至2022年底累计服务三代测序检测样本量突破10万人份,服务终端客户超过1500家。科学界的里程碑事件与临床应用的规模化验证,共同构成了长读长测序需求增长的基本盘。

常见问题

ZMW芯片的量产难度主要在哪里?

ZMW的核心是让每个纳米孔只允许一条DNA模板进入,并在荧光信号时间差异中识别碱基。这要求纳米孔阵列在芯片上高度均一,任何制造偏差都会影响信号读取的准确性。官方资料显示,从2003年ZMW原型发表到2010年首款商业化机型推出,中间经历了7年研发周期,可见制造精度爬坡是供给放量的核心制约。

PacBio和ONT的扩产节奏有何差异?

PacBio走的是“高精度、高通量”路线,2022年推出的Revio系统是其史上最高通量机型;ONT则凭借MinION的便携性切入差异化场景,2015年正式商业化后持续扩展应用边界。两条技术路线的扩产节奏不同,但都受制于各自核心部件的制造与良率爬坡,具体产能数据需以厂商后续公布为准。

未来2-3年供需格局会如何演变?

从产业事件看,2022年PacBio推出Revio、齐碳生物完成7亿元融资、illumina宣布布局长读长产品,均指向供给端投入的加速。但供给放量能否匹配需求增速,取决于ZMW芯片良率提升速度、新机型市场导入节奏,以及临床应用场景的拓展深度。判断供需周期阶段的关键指标,是单碱基测序成本的下降曲线与终端应用渗透率的相对变化,建议以厂商后续披露的装机量与通量数据作为验证依据。